אוטיזם מורכב ממכלול של בעיות נוירולוגיות כתוצאה מפגם תפקודי במוח הפוגע ביכולות התקשורתיות, החברותיות והאינטלקטואליות ולכן פוגע בהתפתחות התקינה של הילד. הסיבה המדויקת להתפתחות האוטיזם עוד לא לגמרי מובנת. להומאופתיה יש הרבה מה להציע בנושא, היות וזאת רפואה הוליסטית יש ביכולתה להקל על התסמינים הפיזיים כמו גם הרגשיים ולחזק את תהליך ההבראה בילד. הומאופתיה היא רפואה טבעית, בטוחה וללא תופעות לוואי ויכולה להתלוות לטיפולים רפואיים אחרים.

דוברת אגודת אלו"ט (האגודה לאוטיזם), גברת רותי סיוון: "התחלנו לעבוד בשיטת
ההומאופתיה באלו"ט לא מזמן. אנחנו מעודדים את הטיפול ההומאופתי כטיפול סביבתי לאוטיזם שלא בא במקום הטיפול הפרא- רפואי. לדוגמא: אם הילד צורח כל הזמן והטיפול ההומאופתי מרגיע אותו, אז הרבה יותר קל לטפל בטיפול הפרא- רפואי. כמו כן, אם הילד  סובל מנדודי שינה ומערנות מוגברת כחלק מבעיית האוטיזם והטיפול ההומאופתי עוזר לו בשינה, מובן שקל יותר לאחר מכן להגיע אל הילד. אני חייבת לציין כי הורים טענו כי הטיפול ההומאופתי עזר מאוד לילדם האוטיסט, ויש ברשותנו אף מכתבי תודה רבים. אולם ישנם גם משפחות שטענו שהטיפול לא עזר ונשרו. אנחנו באלו"ט אפשרנו את הטיפול ההומאופתי כדרך נוספת שעשויה להועיל, כיוון שהאוטיזם הוא עדיין אניגמה, ולרפואה אין תשובות. ואכן, בטיפול ההומאופתי היו הצלחות, והורים רבים היו מרוצים, שווה לנסות.