הומאופתיה יעילה מאוד בטיפול בשוק אנפילקטי כתוצאה מאלרגיה. היא גם אפקטיבית בריפוי אלרגיות למאכלים, עובש, קרדית אבק הבית ועוד.... האלרגיה נובעת בדרך כלל מחולשה של המערכת החיסונית ומטרת הטיפול ההומאופתי הוא תמיכה בגוף המטופל וחיזוק המערכת החיסונית שלו.